si habéis cambiado el motor comprobad que todos los conectores estén bien conectados y que no se ha fundido ningún fusible comprobad los conectores marrón y gris de la columna izquierda del motor los RS232 que van a las centralitas, entiendo que si podéis conectar el ordenador será por que por lo menos si que tiene alimentación el cuadro, y ¿habla y reconoce todas las centralitas? ninguna da error? tener en cuenta que se habéis sustituido el motor y la bomba de inyección e inyectores son los del nuevo motor y no los antiguos debéis codificarlos ya que sino estará en modo bloqueo con el anti-arranque si te da alguna avería, ¿cual es?
¿quien a cambiado el motor? concesionario oficial, taller no oficial o tu mismo